На зубах живут микробы, похожие на своих родственников в почве, а не на тех, что на языке

На зубах живут микробы, похожие на своих родственников в почве

Ученые считают, что полость рта – идеальное место для изучения различных микроорганизмов. Рот это не только начало желудочно-кишечного тракта, но и особенная среда, очень разнообразная в микробном отношении. Для ученых это идеальное место исследований, чтобы ответить на вопросы о микробиомах и их эволюции. Мурат Эвен- доцент кафедры медицины в Чикагском Университете.

Он считает, что существует степень специфичности обнаружения определенных паттернов микробов разных зонах ротовой полости. Удивительно, но факт: те микробы, которые традиционно обитают на языке, значительно отличаются от микробов, обнаруженных на зубном налете и зубах.


Этому факту ученые посвятили новое исследование. Они акцентировали свое внимание на особенностях микробных линий рта с помощью методик секвенирования, чтобы таким образом получить лучшее представление о микробиоме ротовой полости. Генетический подход дал возможность изучить геномы всех микробов, найденных в исследуемой среде. Обычно, когда изучается микробная среда, то берутся образцы и считывается лишь небольшая часть присутствующих геномов.

Этого достаточно, чтобы идентифицировать широкие категории микробов. Новый комплексный подход, названный метагеномикой, позволил секвенировать все содержание ДНК всех образцов.

Таким образом исследователи смогли реконструировать целые микробные геномы, идентифицировать их новые жизни и выяснять, какие среды им более подходят для жизни. К примеру, некоторые виды микробов сгруппировать в шесть отдельных структур, что указывает на их недавнюю самостоятельную эволюцию.


Сравнив эти группы с другими группами микробов за пределами человеческого тела, обитающими в кишечнике животных и даже в почве, они обнаружили, что микробы из зубного налета находятся в тесной связи с микробами, обнаруженными в обычной почвенной грязи.

А те микробы, которые присутствуют на языке, аналогичны группам микробов, присутствующих в желудочно-кишечном тракте.

Ссылка: Алон Шайбер и др., Функциональные и генетические маркеры разделения ниш среди загадочных членов микробиома ротовой полости человека, Биология генома (2020). DOI: 10.1186 / s13059-020-02195-w